Fogadóépületét az 1847-ben épült klasszicista Indóházban rendezték be, mely a jellegzetes vasúti építészeti stílus jegyeit hordozza és amelynek megnyitóján Széchenyi István és Kossuth Lajos is részt vett. Az udvaron található, romantikus stílusú Vízházat pár évvel később építették hozzá. A mögötte található, száz méter hosszú, egykor raktárként funkcionáló épület ma a kiállítás felnőtt játszóterének, az akadálypályának, valamint a légvédelmi kiállításnak ad otthont. A múzeum nem csupán egy emlékpark: a hatvanezer négyzetméteres területen és több mint négyezerötszáz négyzetméteres fedett kiállítótérben egy interaktív élményközpontot is helyet kapott. Különlegessége, hogy a látogatók nem csupán megtapinthatják, sok esetben VR szemüvegen keresztül vizsgálva – vagy akár repülőgép belsejébe lépve – belülről is megtekinthetik a kiállított tárgyakat, melyek műszaki vagy történeti hátteréről interaktív asztalok segítségével tudhatnak meg többet.